Trypanosoma cruzi es el protozoo parásito responsable de la enfermedad de Chagas, patología de alta prevalencia en América Central y del Sur, donde causa serios problemas de salud pública. Los RNAs largos no codificantes (lncRNA), se definen como RNAs cuya secuencia supera los 200 nucleótidos y no son traducidos a proteínas. Se ha descrito que los mismos participan de mecanismos de regulación génica a diferentes niveles, afectan diversos procesos biológicos como la diferenciación y el ciclo celular y son capaces de interaccionar con DNA, RNA, proteínas. En tripanosomátidos, solo recientemente se han descrito lncRNAs en T. brucei, habiendo un único reporte de un lncRNA funcional involucrado en la diferenciación de este organismo. Con estos antecedentes, en la presente propuesta pretendemos identificar y caracterizar lncRNAs en T. cruzi.