Mi línea de investigación se centra en el análisis de la variabilidad genética en distintos organismos. Inicialmente mi trabajo implicó el estudio de la variabilidad genética de insectos utilizando técnicas citogenéticas y moleculares. Desde el año 2004, me centré en el análisis de la variabilidad genética en virus y bacterias que afectan la salud animal, con el objetivo de brindar información epidemiológica y proveer de herramientas biotecnológicas para su diagnóstico y caracterización. Mi grupo de investigación realizó los primeros estudios moleculares en Uruguay de los principales virus que afectan a canes y aves de producción industrial. En cánidos, caracterizamos las variantes circulantes en nuestro territorio, y realizamos estudios filodinámicos y filogeográficos de parvovirus y distemper. Hemos extendido nuestros estudios a Argentina, Brasil y Ecuador para analizar la evolución del virus en Sudamérica. También hemos caracterizado genéticamente cepas del virus de Distemper canino y descrito nuevos genes blancos para estudios filogenéticos. En virus de aves, realizamos los primeros reportes de Gumboro y bronquitis, dos de los virus que generan las mayores pérdidas económicas en la industria avícola uruguaya y mundial. Hemos analizado su variabilidad y patrones evolutivos en cepas uruguayas, argentinas y norteamericanas, y estamos trabajando en un nuevo sistema de clasificación y en la determinación de las vacunas más adecuadas para controlarlos. Como parte de los análisis de variabilidad en los virus caninos y aviares, también realizamos análisis de cuasiespecies, procesos de co-infección y recombinación utilizando secuenciación masiva de genomas. Paralelamente a los estudios virales, desarrollé una línea de investigación en la bacteria Campylobacter fetus con el objetivo de diagnosticarla y caracterizarla molecularmente. Esta bacteria es un importante patógeno del ganado ya que genera infertilidad y abortos. Mi grupo de investigación publicó los primeros análisis moleculares realizados en Uruguay sobre esta bacteria, y actualmente participamos en la secuenciación de genomas de varias cepas , los cuales tienen un gran impacto en el diagnóstico y evolución de esta especie. Además de la caracterización genética, desarrollamos nuevas metodologías de diagnóstico y tipificación, aplicadas tanto a virus como a bacterias, utilizando técnicas de PCR en tiempo final y real. Desarrollamos y publicamos metodología que se constituyeron en los primeros reportes uruguayos de una técnica de PCR en tiempo real aplicada a la identificación y caracterización de virus aviares. En el año 2019, nuestro grupo de investigación participó en la creación de la Plataforma Genómica de Facultad de Ciencias-Udelar de secuenciación masiva Illumina, que se encuentra actualmente instalada en nuestro laboratorio.  Esto nos ha permitido obtener diversos genomas virales en humanos, animales y plantas, generando una nutrida colaboración con investigadores de la Universidad y otras instituciones. Durante la pandemia, desarrollamos un proyecto sobre SARS-CoV-2 que nos permitió obtener genomas de cepas uruguayas de coronavirus y otros virus respiratorios humanos. Para avanzar en el conocimiento de los patógenos en estudio, continuamos desarrollando una red de investigación con centros nacionales e internacionales. A nivel nacional estamos colaborando otras facultades de la Udelar, organismos oficiales y laboratorios privados. Internacionalmente, estamos colaboramos con centros de Argentina (INTA) y México (Universidad de Guadalajara). Esto nos ha permitido convertirnos en referentes para el estudio genético de virus caninos y de avicultura industrial a nivel nacional e internacional.