1. REGULACION DE LA EXPRESION GENICA EN CANCER- La extensa desregulación de ARNs no codificantes en cáncer, sumada a las grandes ventajas del uso de ARNs pequeños como biomarcadores, posiciona estas moléculas como candidatos a biomarcadores. Nuestro grupo ha identificado y caracterizado funcionalmente varios ARNs no codificantes pequeños que están desregulados durante la diferenciación de las CSCs de PCa y que se ven significativamente desregulados en muestras clínicas de PCa (miR-183, miR-301b, miR-130b, svd886-3p y svd886-5p, vtRNA2-1, vtRNAs).También investigamos aspectos básicos de la interacción microRNA-mRNA utilizando una aproximación bioinformática original y biológicamente relevante. Por otro lado, las células madre de cáncer (CSCs) continúan siendo un problema de alta relevancia en cáncer, con el que colaboro con la Dra. Rodriguez-Teja.

La enfermedad de Chagas, enfermedad continúa teniendo una alta prevalencia en América central y del Sur, afectando en particular en las áreas rurales y más pobres. A pesar de ser una enfermedad conocido desde hace mucho, el arsenal terapéutico del que se dispone es muy escaso. La falta de inversión en este sentido la califica actualmente como una enfermedad tropical desatendida (NTD) y por tanto es muy importante continuar investigándola. Nuestro grupo del LIM-FCiencias, investiga la regulación de la expresión génica en este parásito, habiendo transitado desde la etapa del gen a la genómica realizando múltiples contribuciones. Hemos investigado la regulación génica a nivel global, utilizando transcriptómica, proteómica y ribosome profiling, durante la diferenciación de T. cruzi del parásito a la forma infectiva y durante el ciclo proliferativo en el estadío no infectivo que ocurre en el insecto. Yo lidero una investigación destinada a comprender identificar las proteínas y los procesos moleculares necesarios para la proliferación del parásito, que demostró que la traducción es fuertemente regulada durante la transición replicativa. Surgen de estos trabajos, hipótesis experimentales sobre regulones postranscripcionales mediados por secuencias nucleotídicas y proteínas reguladoras que hemos identificado y que ahora estamos validando experimentalmente. Estamos construyendo sistemas de genes reporteros y etiquetando RBPs por edición genómica CRISPR/Cas9 para estudiar su función.

El cáncer es la enfermedad genética de más alta incidencia y las ciencias ómicas recientemente revolucionan su manejo. En Uruguay existe la necesidad de incorporar los nuevos adelantos de la genómica en la práctica médica oncológica. Debido a la experiencia que nuestro grupo ha desarrollado en genómica de cáncer por la investigación básica, realizamos el proyecto de cáncer de cólon hereditario informado que permitió estudiar 70 familias uruguayas. Un nuevo proyecto relacionado que busca desarrollar un ensayo destinado al análisis genómico integrado de variantes accionables comunes y vinculadas a la inmunoterapia acaba de iniciarse en nuestro grupo. Trabajamos también para generar de una cohorte de pacientes con PCa avanzado, resistente a la primera línea de tratamiento hormonal, para luego estudiar un grupo de ARNs circulantes de interés para nuestros proyectos y la predicción.  Recientemente colabramos en el estudio de variantes accionables para tratamiento de Psoriasis Severa.